國有企業完善治理結構包含“三會一層”機構設置、人員產生和組成、職權、議事規則以及經營層薪酬激勵等方面，涉及《公司章程》、“三會”《議事規則》、“三重一大”決策機制、國有企業負責人薪酬激勵等內容。
其中，“三會一層”指的是股東會、董事會、監事會、經營層。
股東會（股份有限公司的稱作股東大會），是由全體股東組成，按照《公司法》、《企業國有資產法》等規定決定公司經營管理的重大事項的機構，是公司內部的最高決策機構。
董事會是由全體股東或職工代表民主選舉的董事組成的、負責執行股東（大）會決議的常設機構。除法律和公司章程規定應由股東（大）會行使的權力之外，其他經營事項均可由董事會決定。公司董事會是公司經營決策機構，董事會向股東（大）會負責。
監事會是由股東（大）會選舉的監事以及由公司職工民主選舉的監事組成的，對公司的業務活動進行監督和檢查的法定必設和常設機構。監事會設立的目的在于防止董事會、經理濫用職權，損害公司和股東利益。
經營層（或稱經理層）是指由董事會聘任的、執行董事會決議、負責企業日常生產經營管理活動的高級管理人員。經營層依法行使管理生產經營、組織實施董事會決議等職權。
國有企業在優化治理結構的時候可參考以下法律、政策：
《中華人民共和國公司法》
《中華人民共和國企業國有資產法》
《企業國有資產監督管理暫行條例》
《中共中央、國務院關于深化國有企業改革的指導意見》
《國務院辦公廳關于進一步完善國有企業法人治理結構的指導意見》
《中華人民共和國工會法》
《企業工會工作條例》
《關于進一步推進國有企業貫徹落實“三重一大”決策制度的意見》
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